Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Usp35M0QWN7 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp35M0QWN7 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms