Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20878L7N244 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms