Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm29394H3BIW7 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm29394H3BIW7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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