Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fndc1E9Q043 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Smim24-201ENSMUST00000105322 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm29684-201ENSMUST00000220248 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr1417-201ENSMUST00000061235 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Teddm3-201ENSMUST00000170665 1346 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Fndc1E9Q043 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms