Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Tgfbr3lD3YZZ2 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Tgfbr3lD3YZZ2 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms