Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

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Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6133B2RY53 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
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Gm6133B2RY53 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Gm6133B2RY53 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms