Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Clrn2B2RVW2 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Clrn2B2RVW2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Clrn2B2RVW2 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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