Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Brpf1B2RRD7 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Brpf1B2RRD7 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms