Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
AmfrQ9R049 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
AmfrQ9R049 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AmfrQ9R049 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms