Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VapbQ9QY76 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VapbQ9QY76 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VapbQ9QY76 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms