Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Arl6ip1Q9JKW0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arl6ip1Q9JKW0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms