Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Alyref2Q9JJW6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Alyref2Q9JJW6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Alyref2Q9JJW6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms