Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cldn12Q9ET43 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cldn12Q9ET43 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cldn12Q9ET43 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms