Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET35

Tnfrsf13b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnfrsf13bQ9ET35 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tnfrsf13bQ9ET35 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms