Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES97

Rtn3, Reticulon-3, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn3Q9ES97 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rtn3Q9ES97 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtn3Q9ES97 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtn3Q9ES97 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.9 ms