Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ripk4Q9ERK0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ripk4Q9ERK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ripk4Q9ERK0 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ripk4Q9ERK0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms