Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tfip11Q9ERA6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tfip11Q9ERA6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tfip11Q9ERA6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms