Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR7

Ppp1r12a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12aQ9DBR7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ppp1r12aQ9DBR7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ppp1r12aQ9DBR7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms