Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rexo2Q9D8S4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rexo2Q9D8S4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rexo2Q9D8S4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms