Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Nop56Q9D6Z1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nop56Q9D6Z1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nop56Q9D6Z1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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