Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ttc9bQ9D6E4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc9bQ9D6E4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttc9bQ9D6E4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc9bQ9D6E4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms