Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4931428L18RikQ9D4S9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
4931428L18RikQ9D4S9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms