Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930564D02RikQ9D4S4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930564D02RikQ9D4S4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms