Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Phf6Q9D4J7 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Phf6Q9D4J7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.4 ms