Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Syce1Q9D495 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Syce1Q9D495 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Syce1Q9D495 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms