Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
4933428M09RikQ9D3X3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
4933428M09RikQ9D3X3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms