Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
1700029F12RikQ9CRB4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700029F12RikQ9CRB4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms