Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
4931417E11RikQ9CR05 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
4931417E11RikQ9CR05 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms