Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ubxn6Q99PL6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn6Q99PL6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms