Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Atoh8Q99NA2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atoh8Q99NA2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atoh8Q99NA2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms