Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prpf19Q99KP6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prpf19Q99KP6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prpf19Q99KP6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 193.2 ms