Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clint1Q99KN9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clint1Q99KN9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms