Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK9

Hars2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hars2Q99KK9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Hars2Q99KK9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hars2Q99KK9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hars2Q99KK9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms