Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn2aQ99KJ0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ubxn2aQ99KJ0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms