Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Def8Q99J78 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Def8Q99J78 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Def8Q99J78 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms