Protein–RNA interactions for Protein: Q96E17

RAB3C, Ras-related protein Rab-3C, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3CQ96E17 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RAB3CQ96E17 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAB3CQ96E17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms