Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cldn16Q925N4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn16Q925N4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cldn16Q925N4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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