Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prss28Q924N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss28Q924N9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms