Protein–RNA interactions for Protein: Q924L1

Letmd1, LETM1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Letmd1Q924L1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Letmd1Q924L1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Letmd1Q924L1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms