Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trim59Q922Y2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trim59Q922Y2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trim59Q922Y2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms