Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Med28Q920D3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Med28Q920D3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms