Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kdm4cQ8VCD7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Kdm4cQ8VCD7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kdm4cQ8VCD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms