Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sumf1Q8R0F3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sumf1Q8R0F3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sumf1Q8R0F3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms