Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PcgF3Q8BTQ0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PcgF3Q8BTQ0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PcgF3Q8BTQ0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms