Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Klhl38Q8BSF5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Klhl38Q8BSF5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Klhl38Q8BSF5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.2 ms