Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smap2Q7TN29 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smap2Q7TN29 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Smap2Q7TN29 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms