Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Syne2Q6ZWQ0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC9.42□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Syne2Q6ZWQ0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms