Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIX5

Rhbdf1, Inactive rhomboid protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdf1Q6PIX5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rhbdf1Q6PIX5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rhbdf1Q6PIX5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rhbdf1Q6PIX5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms