Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NfrkbQ6PIJ4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NfrkbQ6PIJ4 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NfrkbQ6PIJ4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms