Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHN1

Ccdc57, Coiled-coil domain-containing protein 57, mousemouse

Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc57Q6PHN1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccdc57Q6PHN1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc57Q6PHN1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc57Q6PHN1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms